Na operação da Bahia, 85% dos resíduos são reciclados (destinados a venda ou doação), sendo o restante reprocessado. São comercializadas cascas, toretes e resíduos do preparo de cavaco, que são incorporados por clientes na geração de energia renovável, em substituição aos combustíveis fósseis, contribuindo para a redução de emissão de gases de efeito estufa (GEE). Todos os resíduos gerados nas atividades florestais (viveiros, silvicultura, colheita, frotas, P&D, estradas, carregamento e outros) são transportados e armazenados temporariamente nas Centrais de Armazenamento de Resíduos (CAR), localizadas no Escritório Central em Alagoinhas e nas Fazendas Quatis (Entre Rios) e Salgado (Inhambupe). Em seguida são destinados de forma ambientalmente adequada considerando a tipologia dos resíduos, para:

1. Cooperativa de Reciclagem de plástico, papel e madeira;
2. Logística Reversa no caso de embalagens de defensivos agrícolas;
3. Comercialização de sucata metálica, óleo lubrificante, bags;
4. Envio de Resíduos Perigosos para Aterro Classe I;
5. Envio de Resíduos Comuns para Aterro Sanitário Classe II;
6. Envio de Resíduos de Laboratório para Autoclave.

Em São Paulo, os resíduos gerados na operação florestal são separados e destinados localmente, em cada município. Nas áreas próximas à fábrica de Lençóis Paulista, são coletados e encaminhados até a unidade, de onde seguem para destinação, de acordo com o tipo de resíduo.

Em 2023, a Bracell não registrou impactos significativos relacionados a resíduos.